泽塔奥特曼，一位不懈努力的新生代奥特英雄，心怀对赛罗奥特曼的憧憬， 拜其为师，继承了光之国的宇宙拳法。尽管赛罗对他的评价是“别说抵半个英雄了，最多抵个三分之一”， 但泽塔凭借一腔热血与正义感，为守护地球与宇宙和平而战。“喊出我的名字吧！”

故事始于“恶魔碎片”——贝利亚奥特曼的肉体碎片散落宇宙，能使怪兽凶暴化。 神秘的恶徒利用碎片危及光之国，赛罗与泽塔挺身迎战。激战中，泽塔独自追击怪兽来到地球， 与地球防卫军日本支部机甲部队 “军械库（STORAGE）” 的新人驾驶员 夏川遥辉 相遇。两人合为一体，共同面对来自宇宙与地球的威胁。

在军械库解散与重组、赛雷布洛的阴谋浮出水面后，泽塔与遥辉面对最后的绝望—— 德斯特鲁多斯。在队友与伽古拉的支援下，泽塔以德尔塔天爪形态， 凭借幻界魔剑贝利亚黄昏的力量，终结了这场危机。战后，遥辉选择与泽塔一同离开地球， 继续宇宙之旅，而蛇仓队长也向众人揭露身份，留下“总有一天会再相见”的约定。

“守护生命，贯彻正义——这便是泽塔奥特曼与伙伴们的故事。”